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影响荧光定量 PCR 仪的检测灵敏度的因素有哪些?
一、引物和探针设计
特异性:设计的引物和探针应具有高度特异性,能准确识别目标序列。如果引物和探针与非目标序列发生结合,会产生非特异性扩增,降低检测的灵敏度。例如,在检测呼吸道合胞病毒的研究中,根据复合探针技术原理,以其 F 蛋白基因作为基因靶序列建立检测方法,对引物与探针进行优化与筛选,提高了检测的灵敏度。
结合效率:引物和探针与目标序列的结合效率也会影响灵敏度。结合效率高,能够更有效地启动 PCR 反应,从而提高检测灵敏度。
二、反应体系
酶的活性:PCR 反应中使用的聚合酶活性对灵敏度有重要影响。高活性的聚合酶能够更高效地催化 DNA 合成,提高扩增效率,进而提高检测灵敏度。
dNTP 浓度:合适的 dNTP(脱氧核糖核苷三磷酸)浓度是保证 PCR 反应正常进行的关键之一。浓度过高可能导致非特异性扩增增加,浓度过低则会影响扩增效率,降低检测灵敏度。
镁离子浓度:镁离子在 PCR 反应中起到重要作用,它能影响聚合酶的活性和稳定性。合适的镁离子浓度可以提高聚合酶的活性,从而提高检测灵敏度。但镁离子浓度过高或过低都会影响 PCR 反应的效率和特异性。
三、仪器性能
荧光检测系统:荧光定量 PCR 仪的荧光检测系统的性能直接影响检测灵敏度。高灵敏度的荧光检测系统能够更准确地检测到微弱的荧光信号,从而提高检测灵敏度。例如,朗基实时荧光定量 PCR 仪(如 Q2000B、Q1000+)在荧光检测灵敏度、温度控制精度、操作便捷性等方面优于 ABI 7500,尤其适合对成本敏感、需高通量或低拷贝检测的实验室。
温度控制精度:精确的温度控制对于 PCR 反应的稳定性和重复性较为重要。温度控制精度高的仪器能够更好地保证 PCR 反应的特异性和效率,从而提高检测灵敏度。
Q2000荧光定量PCR仪采用半导体芯片技术:升温速率高达 6-7℃/ 秒,控温精度≤±0.1℃,温度均匀性更好。
双通道同步检测:减少延时误差,缩短实验时间。
多通道扩展:支持至多 21 个通道。
单机运行与断电保护:支持触控屏操作,实验数据安全。
四、样本质量
核酸提取方法:高效的核酸提取方法能够获得高质量的核酸样本,减少杂质的干扰,提高检测灵敏度。如果核酸提取过程中存在杂质,可能会抑制 PCR 反应,降低检测灵敏度。
样本中的抑制物:样本中可能存在的抑制物,如血液中的血红蛋白、土壤中的腐殖质等,会抑制 PCR 反应,降低检测灵敏度。在检测不同类型的样本时,需要考虑样本中可能存在的抑制物,并采取相应的措施去除或减少抑制物的影响。
所以,荧光定量 PCR 仪的检测灵敏度受引物和探针设计、反应体系、仪器性能和样本质量等多种因素影响。在实际应用中,需要综合考虑这些因素,优化实验条件,以提高检测灵敏度。
苏州阿尔法生物提供实验室仪器设备主要有PCR仪、实时荧光定量PCR仪等。
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