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肿瘤基因组突变模式已确定,基因测序为癌症研究提供重要线索

作者: 苏州阿尔法生物 编辑: 阿尔法生物 来源: 苏州阿尔法 发布日期: 2022.04.29
信息摘要:
    通过筛选潜伏在 12,000 多个肿瘤基因组中的数亿个突变,科学研究人员通过基因测序已经确定了 DNA 变化的模式,这些模式可以为癌…

    通过筛选潜伏在 12,000 多个肿瘤基因组中的数亿个突变,科学研究人员通过基因测序已经确定了 DNA 变化的模式,这些模式可以为癌症的遗传和环境原因提供了重要线索。

     这项研究是同类基因组研究中较具规模的。研究组人员在不断增长的伴随癌症的“突变特征”目录中添加了数十个条目,并且在某些情况下,有助于癌症遗传研究。

     西班牙巴塞罗那生物医学研究所的计算癌症生物学家揭示了基因组中无法从较小的数据集中挑选出来的罕见突变模式。当拥有拥较多全基因组时,就可以制造出一套完整的突变特征。目前基因组分析还处于早期阶段,但它在诊断和了解这些肿瘤是如何产生的方面具有较大潜力。

基因突变

   单个癌细胞可能包含数十万个突变,有时超过一百万个,但其中只有少数会直接导致肿瘤的发展。多年来,研究人员一直在通过基因组数据 寻找这些癌症驱动因素,希望他们能找到新的控制方法。

     许多剩余的“旁观者”突变也可以提供信息。一些致癌剂会产生 DNA 变化的特征模式。例如,紫外线可以导致一个 DNA 碱基或“字母”,称为胞嘧啶,在基因组的某些位点被另一个称为胸腺嘧啶的取代。这种变化经常出现在黑色素瘤中。

   在过去的一年中,科学家们分析了收集的肿瘤样本的约 5,000 个全基因组序列,进行了基因测序,为肿瘤基因组突变特征研究奠定了坚实的基础。

    在这项新研究中,该团队分析了英国国家卫生服务局收集的 12,000 多个癌症基因组,这些基因组是英国基因组学 100,000 基因组计划的一部分。然后,研究人员使用之前发布的数据集来验证他们的发现。这项数据验证将涉及开发新的分析工具和能够处理数十万个突变的算法。

这项工作包括来自 19 种肿瘤类型的样本产生了几十个以前未知的突变足迹,其中一些可以追溯到修复 DNA 的特定细胞方法的缺陷。

     布达佩斯自然科学研究中心的癌症生物学家研究人员现在可能已经发现了所有常见的突变特征。但随着癌症基因组项目在全球范围内的蓬勃发展,寻找特定器官中不到 1% 的肿瘤中出现的罕见特征可能会继续进行。

     除了寻找进一步的突变特征外,科研人员还希望能够追踪尚未与致癌事件相关的神秘的特征的起源。他们还想研究其他类型的基因变化:目前的研究重点是一到三个 DNA 字母的变化,但 DNA 序列也可以被删除、插入或重新排列成较大的块。

     研究人员梳理了代表 20 多种不同类型儿童癌症的 1,700 多个肿瘤的基因组,进行基因测序以发掘潜在的药物靶点,并更好地了解癌症在年轻的患者中是如何发生的。总之,希望这些研究会影响到针对个体的癌症控制。但从识别突变到开发有效药物,还有很长的路要走。

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